量子计算场景实用秘籍:开物SDK之自动确定惩罚系数

药物发现场景
药物发现作为生物制药领域的核心环节,致力于寻找对特定疾病具有疗效的潜在药物分子,包括了靶标鉴定、药物设计,合成、评价等多个步骤。其中,分子对接作为药物发现早期虚拟筛选、药物设计的重要技术手段之一,多被用于预测和分析配体(小分子化合物)与受体(蛋白质或核酸)之间的结合过程。
通过计算配体受体之间的空间互补以及能量匹配来寻找其最佳的复合物模式。我们将分子对接过程中的构象采样问题转化为配体原子和受体结合口袋的空间格点匹配问题,通过构建QUBO模型可以在相干光量子计算机上实现求解,再将求得的解转换为空间位置以最终获得复合物pose信息,从而加速了分子对接的计算过程,并且还能有效的提高分子对接的规模和质量。
但是,当配体和受体的分子量较大时,或是可选的受体结合口袋较多时,原有的QUBO模型所包含的变量数也会随之增加,这就对量子计算机的比特规模提出了更高的要求。这时我们通过subQUBO方法就可以从原QUBO问题中抽取出部分变量形成若干子问题,并通过迭代更新来优化求解过程,使得分解后的问题求解结果能够不断逼近最优解。
社区发现场景
网络科学是利用数学理论研究数据网络的学科,重点在于分析和表征网络行为。现实世界网络的一个重要特征是它们具有社区结构,这可以通过图方法来实现建模。识别社区结构是理解不同网络结构的重要手段,在社交网络、金融风控、生命科学等领域都有巨大应用价值。
尤其在大规模网络中,检测社区结构更加有价值,有许多应用产品都是使用社区检测算法来揭示网络中的隐藏信息。例如,在社交网络中找到具有相似行为的用户,通过他们的购物习惯对电子商务中的客户进行分类能够有效提升营销成功率。同样,社区检测在设计延迟容忍网络中的网络协议和在线社交网络中的蠕虫遏制中能够发挥重要作用。在数据网络中,识别恶意用户社区是很有帮助的。在智能营销中社区发现具有一些有趣的应用,例如增强在线购物者、产品推荐和定向广告。在大型购物网络中,社区检测可以用于分类客户并根据他们的购买历史提供未来购买的建议。
社区检测算法的性能在很大程度上取决于网络的拓扑结构,网络可以是静态的或动态的。模块度最大化和谱聚类分别被认为是静态网络中社区识别的主要方法。我们将传统的基于模块度的社区发现模型转化为QUBO形式,并使用玻色量子的相干光量子计算机实现了求解。而往往在实际场景中,在线网络用户数或者生命科学领域的细胞数量非常庞大,所涉及的计算规模都会超过现有量子比特数量的限制,那么我们就可以借助subQUBO算法算法,进行问题拆分,最终完成求解。
QUBO问题的分解
令可活动变量下标集合为Sf。令固定的变量下标集合为Sc=S\Sf,取值为
如此,原始的QUBO问题可改写为以xi∈Sf为变量的问题:
其中,二次项为:
一次项为:
常数项为:
相干光量子计算机直接求解的Ising模型和QUBO模型是等价的,在实现时直接对Ising模型抽取子问题也可以达到同样的作用。优化过程:
参考前一节问题的分解,我们在选取变量集合之后就可以用原问题和当前的解生成新的子问题。子问题的变量就是我们所选的变量集合。求解子问题之后,将变量的改变在原问题的解中做相应的更新。有时subQUBO算法会维护一个解集合,这只需将新产生的解加入到解集合中并对维护的解集作相应更新。
全局优化
子问题如何选取?
总结
现实中的问题普遍存在大规模求解的情况,subQUBO算法为用户提供了一种全新的解决思路,并证明其是一种用于解决大规模QUBO问题的有效方法。它通过将原始问题分解为多个子问题,并在迭代过程中优化这些子问题的求解效果,从而逐步逼近全局最优解。
在药物发现和社区发现等实际应用中,subQUBO算法能够处理超出量子计算机比特数限制的问题,提高了量子计算能够覆盖到的问题规模。并且子问题的选取策略也是多样的,可根据实际问题特点选择合适的变量集合。
显然,通过结合经典算法和量子计算,subQUBO算法为解决复杂优化问题提供了新的思路和方法。基于玻色量子自研的开物SDK🔗,用户只需关注建立与场景所对应的数学模型,SDK提供的方法可以自动完成问题分解,用户无需担心其背后的复杂度,这将极大的降低用户使用相干光量子计算机🔗求解实际问题的难度。